به لطف خداوند متعال “سامانه توزیع خمس” در آبان ماه 1395 راه اندازی گردید. در این سامانه مبالغ ساداتی که خیرین محترم به صندوق فاطمیون پرداخت می‌نمایند، در یک حساب تجمیع و به طور سیستمی به واجدین شرایط دریافت خمس که تحت پوشش هستند، پرداخت می شود. آن دسته از سادات محترمی که شرایط زندگی ایشان توسط پشتیبانان محترم صندوق مورد بازرسی قرار گرفته است، در سامانه پرداخت خمس ثبت نام شده و وجوه دریافتی به طور هدفمند (با توجه به میزان نیازمندی) در میان ساداتی که طبق نظر عموم مراجع معظم تقلید حائز شرایط دریافت سهم سادات باشند، توزیع می‌شود.
